Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms