Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSR1P21757 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSR1P21757 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSR1P21757 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSR1P21757 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSR1P21757 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSR1P21757 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MSR1P21757 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSR1P21757 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSR1P21757 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSR1P21757 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MSR1P21757 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSR1P21757 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSR1P21757 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSR1P21757 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSR1P21757 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSR1P21757 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSR1P21757 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms