Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD53P19397 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD53P19397 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD53P19397 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD53P19397 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD53P19397 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD53P19397 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD53P19397 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD53P19397 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD53P19397 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD53P19397 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD53P19397 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms