Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFMP07197 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms