Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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