Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d1O08532 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms