Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5218F6YH22 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms