Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms