Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tube1Q9D6T1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms