Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms