Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp27Q8CEG8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp27Q8CEG8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms