Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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