Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WhrnQ80VW5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms