Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gja6Q6S5G4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms