Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms