Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms