Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Snrpd3P62320 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snrpd3P62320 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms