Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkchP23298 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms