Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms