Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Phf11cB4XVP9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Phf11cB4XVP9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Phf11cB4XVP9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Phf11cB4XVP9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Phf11cB4XVP9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Phf11cB4XVP9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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