Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms