Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REREQ9P2R6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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