Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms