Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms