Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT35Q92764 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT35Q92764 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms