Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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