Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cnpy4Q8BQ47 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cnpy4Q8BQ47 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cnpy4Q8BQ47 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cnpy4Q8BQ47 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cnpy4Q8BQ47 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnpy4Q8BQ47 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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