Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rims3Q80U57 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms