Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms