Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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