Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LDLRAP1Q5SW96 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms