Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms