Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms