Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms