Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms