Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms