Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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HOXD3P31249 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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