Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RarbP22605 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RarbP22605 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RarbP22605 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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