Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3BO95985 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOP3BO95985 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms