Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmem200cJ3QK46 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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