Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm2564F6Z9S8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm2564F6Z9S8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm2564F6Z9S8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm2564F6Z9S8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm2564F6Z9S8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm2564F6Z9S8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm2564F6Z9S8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2564F6Z9S8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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