Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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