Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms