Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms