Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSMCE1Q8WV22 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms