Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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