Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AmbpQ07456 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AmbpQ07456 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms