Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Strn4P58404 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Strn4P58404 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Strn4P58404 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Strn4P58404 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms