Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtaP09225 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtaP09225 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtaP09225 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtaP09225 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtaP09225 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtaP09225 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtaP09225 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms