Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm20518E9Q548 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm20518E9Q548 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm20518E9Q548 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm20518E9Q548 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm20518E9Q548 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm20518E9Q548 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm20518E9Q548 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm20518E9Q548 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm20518E9Q548 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm20518E9Q548 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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